Действие игры происходит в 2047 году, а вам предстоит выступить в роли Пророка. Он возвращается в Нью-Йорк, где узнает о том, что город закрыт куполом Nanodome, который был создан корпорацией C.E.L.L. Жителям говорят, что Nanodome нужен для их защиты и очистки метрополисов от последних цефов, однако, на самом деле, его строительство является частью тайной операции по захвату технологий ради мирового господства. Надев усовершенствованный нанокостюм и вооружившись смертоносным луком и разрушительными инопланетными технологиями, Пророку предстоит сорвать коварные планы C.E.L.L. и уничтожить оставшихся пришельцев.
